目前有关孔雀鱼的基因研究，都是建立在下面几个前提下，我想这个前提也不会有错，不然很多理论与所发生的现象都没有办法说明。

1.孔雀鱼的性染色体与人类相同是[XY]型

2.体染色体上的基因有十多条以上

上面两个前提中提到了性染色体与体染色体，接下来说明一下，基因(Genes)上的染色体主要可以归类于两种，一种是决定性别的染色体，基因代号是[Y]及[X]，也就是性染色体。而非性染色体的就称他做体染色体。

先说明一下性染色体[XY]：

复习一下，国中有学过，男女性别的决定是在[XY]染色体上的，所以当公母结合之后，细胞产生减数分裂(减数分裂即是二倍体转变成一倍体的过程)，由父母双方各提供一个染色体，经过再结合之后产生新的性染色体： 妈妈的性染色体(XX)->(X+X)   爸爸的性染色体(XY)->(X+Y)

儿子(XY)：由爸爸提供Y基因，妈妈提供X基因

女儿(XX)：由爸爸提供X基因，妈妈提供X基因

上列可以看到，儿子遗传了由父亲给的Y基因，而X基因必由母鱼给定。而女儿因为没有Y基因，所以XX基因各由父母亲给定。

只有公鱼才会有Y基因，也就是说Y基因是决定性别的因素。

接下来说明一下性染色体在孔雀鱼上的作用情形。

日本蓝基因是带在公鱼身上的基因，因此把公鱼的性染色体符号标成[XY(J)]，其中[Y(J)]代表带有日本蓝(JAPAN BLUE)表现的Y染色体。 日本蓝母鱼[XX]x[XY(J)]日本蓝公鱼

仔鱼公[XY(J)]

仔鱼母[XX]

可以看到，仅仅有公鱼遗传到了[Y(J)]的形式，也就是说日本蓝只会表现在公鱼身上。这是必然的结果。因为Y基因只会遗传给公鱼。因此我们就叫这种只会在公鱼身上表现的基因，称做限性基因。这很重要，因为孔雀鱼的育种及改良，几乎都从这几个观念为基准点做抉择。

再看一下草尾的表现形式，草尾基因是带在母鱼身上的，因此将母鱼的染色体符号标成[X(GL)X(GL)]，其中[X(GL)]代表带有草尾(GLASS)表现的X染色体。 草尾母鱼[X(GL)X(GL)]x[X(GL)Y]草尾公鱼

仔鱼公[X(GL)Y]

仔鱼母[X(GL)X(GL)]

可以看到，公母鱼都遗传到了[X(GL)]的基因，就是说公母都会有草尾的表现，这也正是为什么母鱼身上也会有草尾斑的原因了。我们将这种带在母鱼[X]上的基因，称作伴性基因。

观察孔雀鱼公母鱼的表现，你可以发现公鱼漂亮的多，因此可以猜测大部分的表现都是限性基因，如：白金、珊瑚、蛇王、日本蓝等等。少数伴性基因也很好判断，母鱼发色浓厚且明显就可以判断是伴性基因，如：草尾、礼服、黑尾礼服。

有些表现会因为基因重组，而同时存在于[XY]上，如礼服[X(T)Y(T)]，此类鱼种的公母鱼表现会更加接近，同时表现上会比[X(T)Y]或是[XY(T)]来的更好。所以要改鱼的时候，首先需了解想要保存的表现位在哪条染色体上，否则做起来也是徒劳无功。

关于基因重组，写起来落落长，孔雀鱼的新品种改良，主要也是*这点，所以将会另辟文章讨论。

若是你用上述的法则去判断白子基因，你会被搞的一头雾水。白子公母都会有，所以应该是伴性基因。但白子公鱼与普通种母鱼，生下来却又全部没有白子??到底是怎么回事。

因为白子表现，并不是位在性染色体上的，所以上述的法则并不适用。白子表现是位于体染色体上，他的遗传方式是依照门德尔的独立法则来运作的。体染色体上的基因与遗传方式，将留在第二篇做说明讨论。