产生水质色度的原因主要是带色物质溶解于水中而引起的。这些带色的物质主要来源于如下几点：

1.沉木

布置有沉木的水族箱，经常会使水族箱中的水质带有淡黄褐色的呈色现象。这是因为沉木中的抽取物，例如：腐殖酸、腐化物等等溶解于水中所致。

2.肥料

一些水草肥料中因为含有铁离子，它们和螯合剂形成黄色或淡红色的化合物，加入水中后，即使微量，也可能导致水族箱中的水质呈淡黄褐色。

3.饵料

人工合成的饵料中往往常含有所谓的“扬色剂”或“增艳剂”等可使观赏鱼类显色的色素成份，这些色素成份可能自投饲过程中被溶解，或自水族生物的排泄物中被分解出来，而使水质呈现颜色。

4.药剂

一些水族专用的治疗鱼病的药剂，例如：甲基蓝、孔雀石绿、土霉素等等；以及一些处理水质的药剂，例如：硝化菌、黑水等等；均含有不同成份的色素，因而在添加使用后，都会造成水质不同情况的呈现颜色。

以上这4种可能造成水族箱水质呈色的原因，虽然，因为带色物质来源不断，而造成观赏视觉上的不快，但可以在过滤系统中加入活性炭增强水质净化处理，一般大约2-3天后情况就可明显改善，另外，增加换水的次数以及换水量也可使水质中的色度降低。

5.生物性的白浊

这种情况容易发生在新设立的水族箱中。过滤系统正常运作，原本清澈透明的水质会突然呈现白浊现象，甚至连使用活性炭、水质澄清剂都丝毫不能改善水质情况。

这是由于引发白浊现象的罪魁祸首是一种原生动物的纤毛虫微生物在水中大量繁殖的结果。这种原生动物非常微小，大多寄生在鱼只体内，但若水质中的养分可供它们摄取时，也可以直接生活于水中并开始大量繁殖。数量多时就会造成水质呈现乳白色而模糊不清。

处理这种情况，最好的方法就是使用消毒杀菌类药剂将它们杀灭。但是，这种处理方式对水中的硝化细菌同样会造成严重伤害，并使水中微生物的生态平衡系统受到破坏。因此，建议在使用消毒杀菌类药剂消除白浊现象后，应该立即更换部份水并加入硝化细菌，使受到破坏的微生物生态平衡系统迅速恢复稳定的状态。